该院实行“机构开放、人员流动、内外联合、竞争创新、政产学研一体化”的运行机制,吸引两岸高层次专家“驻库”研究,聚集和建设专业的研究团队,打造智库品牌。
曹小衡:南开大学台湾经济研究所所长、教授
单玉丽:福建社科院现代台湾研究所所长 、研究员
刁晏斌:北京师范大学现代汉语研究所所长、全球华语比较研究中心主任、中国语文现代化学会海峡两岸语言文字研究会会长,教授
窦为龙:《台声》杂志社总编辑、执行副社长
郭伟峰:中国评论新闻社社长兼总编辑
李逸舟:海峡两岸研究中心研究员、前主任
李行健:教育部语言文字应用研究所研究员、国家语委咨询委员,两岸语言文字交流与合作协调小组副组长
李鸿阶:福建社科院副院长、研究员
王建民:中国社科院台湾研究所研究员,两岸一家亲研究院名誉院长
杨毅州:中华全国台湾同胞联谊会副会长
严峻:全国台湾研究会副秘书长兼研究部主任、研究员
郑剑:海峡两岸关系研究中心特约研究员
谢必震:福建师范大学闽台区域研究中心主任、教授、博士生导师。任中国海外交通史研究会会长
张世平:教育部语言文字应用研究所所长、两岸语言文字交流与协调小组秘书长、中国社科院研究生院语用系教授
朱磊:南开大学台湾经济研究所教授、博导
张振兴:中国社科院语言研究所研究员、博导,两岸语言文字交流与合作协调小组成员